informations scientifiques pour coup de pouce en SF?

[Melindra]

Merci, je sais que ce n'est pas une question facile. Je sais ? peu pr?s o? je voudrais aller, mais je voudrais surtout savoir si c'est coh?rent. Mon roman repose essentiellement l? dessus, en fait...

[desienne]

Pour t'aider un peu :
adn codant / adn non codant => soit exons / introns
Un g?ne est donc constitu? d'introns et d'exons.
les exons sont les parties qui sont utilis?es dans la transcription ( ADN => ARNt => ARNm => Ribosomes => Prote?ne )
Notre g?nome contient une immense majorit? de code non utilis? (suppos?) et une tr?s petite partie de code utilis? (donc nous).
Ce qu'on apelle adn non codant (? tort, c'est pourquoi on dit introns) est probablement utilis? mais pas de mani?re classique.
Je m'explique :
Pendant longtemps on a dit : une prote?ne cod?e correspond ? un g?ne et une certaine s?quence dans le g?nome. On a donc remarqu? qu'effectivement, la majorit? du g?nome ne semblait pas ?tre utilis?e. Pourquoi ? Myst?re... on a ?voqu? que des r?sidus, du code ancien qui n'est plus utilis?. Certes, mais la nature est pingre et toute chose trouve son utilit?.
Ensuite, on s'est rendu compte que plusieurs exons (donc plusieurs s?quences diff?rentes sur des g?nes diff?rents) peuvent servir ensemble ? coder pour une ou plusieurs proteines. Cela veut dire que pour fabriquer telle ou telle proteine, on va prendre une pinc?e de cet partie de l'adn, une autre pinc?e ailleurs, un autre g?ne encore ailleurs, etc ....
Aujourd'hui, on se rend compte que c'est encore plus compliqu? que ?a :
de toutes petites parties de code sont utilis?es pour certaines fonctions synth?tiques c'est ? ce moment l? qu'on est revennu sur la question : mais ? quoi sert la plus grande partie de notre g?nome ? Peut-?tre qu'il sert de r?servoir de petit bouts de code n?cessaires dans certaines synth?se ou activit?s cellulaires.
D'autres, plus audacieux, pensent que cela peut avoir une importance dans le brassage du g?nome, ou bien que cela peut avoir une importance dans l'?volution des esp?ce, d'autre que c'est un r?servoir, une sorte de boite ? outils (? malice ?) g?n?tique dans laquelle le genome peut puiser...

Ta biologiste peut donc "activer" certaines s?quences, encore qu'il va bien falloir expliquer subtilement comment. En effet, on active pas des g?nes comme on appuie sur un bouton.

[alaric]

Bon, alors je vais tenter d'expliquer le plus clairement possible. Si certains d'entre vous voient que j'ai ?crit des b?tises dites le moi vite, ? force, j'ai tendance ? me m?langer les pinceaux.

Pour commencer, faisons dans l'impressionnant:

L'ADN du noyau de toutes les cellules du corps humain mis bout ? bout sous forme d?roul?
pourrait couvrir 300 fois la distance de la Terre ? la Lune aller et retour. Cela repr?sente tout de m?me 1,2.10e11 km

Dans chacune des cellules humaine de 1/100 de mm, la mol?cule d'ADN, riche de 3 milliards de paires de bases, fait plus de 2 m?tres de long.

J'ai commenc? avec ces chiffres pour rappeler la taille de l'ADN.
Mais d'ailleurs, qu'est ce que c'est? C'est La mol?cule des chromosomes qui est le d?positaire des renseignements g?n?tiques dans quasiment tous les organismes. Les renseignements cod?s par l'ADN d?terminent la structure et la fonction d'un organisme.

Un brin d'ADN est compos? de 4 bases associ?es ? un sucre, le d?soxiribose et reli?s entre eux pas des liaisons diphosphoester:



(de gauche ? droite: ad?nosine; cytosine; guanine; thyrosine;le d?soxyribose; et en dessous,la liaison phosphodiester entre deux bases)


Comme on peut le constater dans la d?monstration pr?c?dente, l'ADN ne peut pas rester sous forme d?roul? dans la cellule. Aussi, il devient incroyablement compact gr?ce ? plusieurs repliement succesif.

1) En premier lieu, une base+un sucre+une liaison diphosphosester = un nucl?oside


2) Les nucl?osides s'associeront entre eux => Formation d'un brin d'ADN

3) Deux brin d'ADN compl?mentaire (les bases s'apparient entre elles de fa?on sp?cifique: ad?nosine avec thymine, et cytosine avec guanine; voir sch?ma 7) se fixe l'un ? l'autre pour former la double h?lice d'ADN (sch?ma 8 ) pr?sent? par Watson et Cricks en 1953 (et re?oivent le prix nobel en 1962).



4) La double h?lice s'enroule autour d'une prot?ine (histone) qui permet un meilleur enroulement => formation d'un nucl?osome.

5) Les histones s'enrouleront sur eux m?me => formation de la chromatine

6) Super enroulement de la chromatine => formation de chromosomes (form? de deux chromatides)

r?capitulatif des diff?rents repliements effectu? sur l'ADN (sch?ma 9 et 10):




Dans tout cela, certaines successions de nucl?osides (exemple pris au hasard: ATCCGGTGCTAATGCAGTG) peuvent coder pour la production de proteines (un g?ne). Tandis que d'autres suites de nucl?osides n'ont pas un r?le codant. Toutefois, cela ne veut pas dire qu'ils n'ont pas de r?le.
Certains scientifiques pense qu'il s'agit de vestiges de notre ?volution, tandis que pour d'autre ces paties non codantes n'ont qu'un but utilitaire. En effet, gr?ce ? la longueur d'une mol?cule d'ADN, l'incroyable compression de la mol?cule d'ADN est tr?s stable. Cela permet une bien meilleure conservation du mat?rielle g?n?tique.
Il existe toutefois une seconde raison: les mutations.
Au cours du temps, le code g?n?tique peut souffrir de divers mutations qui peuvent ?tre transmises aux cellules filles lors de la duplication de la cellule m?re. Et lorsqu'il y a mutation, mieux vaut qu'elle ne se d?roule pas dans un g?ne. C'est pourquoi la quantit? de zone non codante est si importante. (les chances de "tomber" sur un endroit important du patrimoine g?n?tique est ainsi diminu?).

M?lindra a dit:
Mon souci est le suivant : mon h?ro?ne va (?videmment) trafiquer l?adn pour activer une s?quence (une prot?ine) qui ? dormait ? dans l?adn non codant. Ce faisant, cela vous para?t logique, possible, qu?il y ait un effet boule de neige et que d?autres s?quences d?adn non codant se trouvent activ?es ? Cela vous para?t-il logique que seulement une partie de cet adn non codant soit activ?e ?

Si tu induit des mutations dans les zones non codantes, tu aura d'infimes chance de produire une nouvelle s?quence codante. Elle est le plus souvent n?faste (comme pour certaines maladies g?n?tiques) ou silencieuse (il y a production de prot?ines suppl?mentaires qui n'auront pas d'impact particulier sur l'organisme. exemple: elles sont d?j? produites par une autre zone codante).

Ensuite, si tu r?alise une mutation, cela peut avoir diff?rents effets, suivant le type effectu? sur ton ADN.
Il existe des mutations ponctuelles qui sont des erreurs qui se produisent au cours de la r?plication (c'est ? ce moment qu'une erreur de copie de l'ADN peut se produire). Un syst?me de corrections d'erreurs existe, mais il n'est pas parfait.
Des mutations plus ?tendues peuvent ?galement apparaitre lors des phases de (duplication/transposition) qui permettent l'apparition de nouvelles copies de g?nes. Les nouvelles copies ?voluent par la suite de fa?on ind?pendante de la version d'origine.

Pour ?tre plus pr?cis, lors de la phase de r?plication de l'adn( schema 11. essaye de comprendre gr?ce au sch?ma et non pas avec les non compliqu? si tu ne connais pas, tu comprendra tout de m?me):



On a trois grand types de mutations:


les substitutions (sch?ma 13) qui constitue a substituer un nucl?oside par un autre.
La d?l?tion est une mutation qui supprime un nucl?oside et ? l'inverse, l'addition en rajoute un.

Pour une explication plus concise et tr?s bien expliqu? sur les mutations, je te conseil quelques pages de ce livre: (lien) de la page 197 ? 200.

Si la mutation se d?roule hors r?plication de l'ADN (par contact avec des agents mutag?nes par exemple) l'ADN ne sera pas r?par? car il n'existe pas de syst?me de r?paration interne ? l'organisme capable de d?tecter l'erreur.

Comme tu le constate, il n'y a pas d'effets boule de neige...enfin seulement au niveau mol?culaire.

Prenons un exemple (et oui, encore un).

En ce moment, mon projet de recherche est l'?tude des m?hanismes de sporulations chez Clostridium difficile. Or la bact?rie ne se prot?ge sous forme de spore, que si les conditions de vie ne lui sont plus favorable.
Donc, suivant ses conditions de vie, un signal chimique est ?mis ou non par la bact?rie. Un r?cepteur captera ce signal et activera ou pas, le mat?riel g?n?tique afin de produire ces d?fenses. En r?alit?, diff?rentes parties codantes de l'ADN interagissent entre elles en se r?gulant.

Maintenant imagine que dans une des parties non codantes que tu as fait mut?e en ADN codant, tu produits une mol?cule qui inhibe le signal chimique. La bact?rie ne peut pas d?clencher sa protection...et elle meurt(ou inversement, ta bact?rie active tout le temps le r?cepteur et se croit tout le temps en danger).
C'est donc un effet boule de neige indirecte.


Enfin, il existe ?galement des parties codantes et non codantes ? l'int?rieur m?me d'un g?ne
(introns parties codantes, et exons...non codants).

Enfin, je ne sais pas si tu veux des informations plus pr?cises sur le g?ne et la fa?on dont il retranscris son information en prot?ines.

J'esp?re que mes explications auront ?t? suffisamment claires pour t'aiguiller quelques peu. Si tu as besoin d'autres informations, n'h?site pas

(ps: d?sol? pour les fautes que ce texte contient, mais je dois dire que j'ai la flemme de me relire ).

[Melindra]

Cela m'aide beaucoup, Desienne, d?j? j'ai les bons termes...! Je vais pouvoir poursuivre mes recherches. et ce que tu me dis est tr?s int?ressant et m?me passionnant.

J'ignorais par exemple qu'une proteine pouvait ?tre cr??e ? partir de plusieurs exons via les m?canismes habituels.

En fait j'?tais rest?e sur l'id?e tr?s simple sur 1/ ma biologiste rep?re la prot?ine qui l'int?resse, comme c'est une proteine "humaine" a priori puisque pr?sente dans l'adn, elle la juge peu dangereuse 2/ elle l'int?gre dans un virus (on utilise le virus de rhume) qui lui va lancer la modification de l'adn: cette nouvelle (en r?alit? ancienne) s?quence d'adn s'intercalerait dans une s?quence utilis?e r?guli?rement par le corps (lors de la cr?ation des cellules sanguines)

C'est la th?rapie g?nique et l? je pense que je trouverais assez facilement les infos. (mes connaissances datent un peu mais je peux creuser)

Concr?tement, il s'agit seulement de changer le go?t du sang en ajoutant une prot?ine (oui c'est un roman de vampires, donc fantastique pas sf, mais c'est un ?quilibre d?licat. ) mais cette modification va avoir d'autres cons?quences. (r?veil d'introns)

Mon id?e est un poil compliqu?e quand m?me puisque au final, ce nouvel ?l?ment dans le sang devrait avoir des r?percussions sur le vampire qui boira ce sang. (je ne sais pas m?me si je suis tr?s claire)

Il faut que j'?crive plusieurs fois le d?roulement des ?v?nements pour que ce soit bien clair pour moi. Donc il me faut les connaissances pour que ce soit coh?rent.

j'h?site donc entre intercaler une nouvelle (ancienne) s?quence ou activer directement l'ancienne et l? je s?che un peu: les ARNt ne s'occupent pas normalement des introns. Sauf si j'intercale une nouvelle s?quence pour faire en sorte que... argh, c'est vraiment tordu.

Edit Alaric, le temps que j'?crive ma r?ponse, tu as post?, je te lis et je r??dite

Edit 2

et encore ? tous les deux, j'ai de nouvelles pistes : Alaric, d'apr?s ton poste, il serait plus cr?dible de ne pas modifier les introns, mais seulement les exons. Bon d?j?, gr?ce ? vous j'aurais ?vit? cette erreur qui me semble ?vidente.... apr?s vous avoir lu!!

On peut imaginer une activation des introns pour tenter de contrebalancer cette modification, un peu comme le "signal" dont tu parles Alaric... j'aime beaucoup cette id?e, c'est tr?s ?l?gant. Cette nouvelle prot?ine agirait en signal....

Bon au niveau cr?dibilit?, les chances que mon h?ro?ne active LA prot?ine qui aboutit ? cela, sont vraiment infimes, mouais. D'un autre c?t? (je raisonne ? voix haute l?) comme elle a choisi cette prot?ine en raison du go?t... cela peut se concevoir.

Ensuite j'avais oubli? le c?t? "miroir invers?" des brins d'adn (c'est pas pour rien que j'ai fait droit apr?s m'?tre plant?e en pharmacie, il faut bien l'avouer )

Vous m'avez vraiment donn? mati?re ? r?flexion, c'est g?nial !! MERCI !!

edit 3 (il faut du temps pour que mes petites cellules grises s'activent) la prot?ine dans le sang de l'humain, peut aussi activer l'adn du vampire qui le boit par ce m?me biais de signal. Oh bon sang, merci. Je vous aime, si si ! Cela fait si longtemps que je me disais que ?a n'allait pas que l?, ?a me semble miraculeux d'avoir une telle piste.

[alaric]

Pour reparir sur ce que tu me dis le gout du sang est en relation directe avec sa constitution, l'h?moglobine (donc gout de m?talique)
L'h?moglobine c'est une prot?ine dont la principale fonction est le transport du dioxyg?ne dans l'organisme humain et chez les autres vert?br?s. L'h?moglobine se trouve essentiellement ? l'int?rieur des globules rouges du sang ce qui leur conf?re leur couleur rouge. L'h?moglobine est constitu?e de quatre globines et de quatre mol?cules d'h?me. Le nom d'h?moglobine provient de deux mots: h?me et globine. On la symbolise par ? Hb ?. Une mol?cule d'h?me est constitu?e d'un ion fer complex? par une porphyrine.les globules rouges sont compos? de 4h?mes de fer afin de mieux stocker l'oxyg?ne.

Ensuite, si tu mange de la viande de porc, le mat?riel g?n?tique du porc ne passera pas dans tes cellules(mais peut-etre que pour un vampire, ?a ne marche pas pareil ). Si tu buvais de l'adr?naline, cela ne produit absolument pas les m?me effet que injecter dans le sang.
Le syst?me digestif est l? pour ?viter ce genre d'interaction justement.

Attention, tu fais un petit abus de langage en parlant des introns et des exons. Les introns et les exons sont les parties codantes et non codantes des g?nes. Pour les parties non codantes ? l'ext?rieur des g?nes, on appel ?a seulement des zones non codantes.
Apr?s il est tout a fait envisageable de modifier un g?ne afin qu'il s'exprime de fa?on diff?rente.


Par contre je pense ? plusieurs point qui peuvent grandement t'interesser.
Tu parle de th?rapie g?nique, voici un excellent lien qui explique absolument toute les techniques de th?rapies g?niques: le lien

Ensuite, pourquoi ne pas utiliser plus avant cette id?e?

Puisque les vampires boivent du sang, ton ami bois celui d'une personne :

- trait? par th?rapie g?nique pour une maladie quelconque. Il poss?de encore dans son sang des virus vecteur de l'ADN insertionnel(il sort de l'h?pital pour rentrer chez lui).
- Un nouveau type de vaccin contre les vampire (?a ne te sauve pas, mais ?a d?g?nere le g?nome du vampire).

Apr?s, un des gros probl?mes de la th?rapie g?nique ? l'heure actuel est de faire s'ins?rer l'ADN vecteur exactement l? ou on le souhaite dans l'ADN receveur.
Cela peut entra?ner de grave mutation (qui peuvent ?tre l?tale).

Donc pour en revenir ? notre vampire: Il boit le sang. Les virus dans le sang de sa victime rentre en contact avec les bact?ries de son syst?me digestif.
Les bact?ries absorbe le virus (normalement le virus est inerte, il va te falloir trouver quelque chose) et lors d'une blessure ? la bouche ou un truc de ce genre, le virus p?n?tre dans son organisme et s'ins?re n'importe ou dans son g?nome.
Ou alors, c'est les globules blancs qui ont mut? suite ? la modification des cellules de la moelle osseuse qui produit les globules blancs(ce qui donne un go?t diff?rent au sang car il y a beaucoup de globules blancs dans le sang). Par contre je ne vois pas trop comment les GB peuvent intervenir dans la modification chromosomique du vampire.

[Garulfo]

Pingu a dit:

J'ai un th?me, j'ai un th?me !

Bon, c'est un peu de l'histoire des sciences, mais voil? :
L'?tat des sciences et des techniques dans les ann?es vingt-trente, en particulier la bio, la m?canique, la physique, la m?decine, la botanique et zoologie (hum, oui, c'est large).

J'ai exactement ce qu'il te faut.

Ce site : http://www.techno-science.net/ propose souvent des r?tro du si?cle pass? sur la science et l'utilisation de la technologie de l'?poque (en plus de news sur les dernieres d?couvertes).

Afin de retrouv? tous les anciesn articles d?j? parut, va sur ce lien : http://www.techno-science.net/forum/search.php et tape r?tro en mots cl?s. Tu verra les 6 pages d'anciens articles s'ouvrir devant tes yeux ?bahis.

Cool, j'avais justement besoin de r?f?rences (mais pour la fin du 19?me en ce qui me concerne). Je vais aller jeter un oeil.

Si quelqu'un a des infos sur les ascenseurs hydrauliques et les m?canismes (horlogerie, automates, etc.) ainsi que les ballons dirigeables, je suis preneuse. J'ai d?j? ?t? faire un tour sur le net mais peut-?tre que quelqu'un a des m?ga r?f?rences (surtout pour les ascenseurs hydrauliques).

[Melindra]

Super, merci Alaric ! Bon en fait je ne comptais pas modifier l'h?moglobine, mais rajouter une prot?ine dans le sang pour modifier le go?t. (je me mets ? la place de mon h?ro?ne, je ne prendrais pas le risque de mourir d'asphyxie en modifiant un truc aussi essentiel )

L'avantage pour les vampires, c'est que comme c''est du fantastique, je peux me permettre une certaine souplesse (tout en restant logique ?videmment) et j'ai bien not? tes id?es. (un rapide copier/coller)

Ok pour le language, je vais revoir mes d?finitions.

Mes derni?res infos en mati?re de th?rapie g?nique datent un peu et je savais que les r?sultats ?taient peu concluants. Merci

[alaric]

est ce que ceux qui cherchaient des informations scientifiques sur le si?cle dernier ont fini par trouver des infos int?ressantes?


Sinon j'ai trouv? un article vraiment tr?s int?ressant sur les gu?pes qui pratiquent la th?rapie g?nique depuis environ 100 millions d'ann?es afin de prot?ger leurs larves.

Tr?s instructifs, et porteurs de beaucoup d'id?es de parasites inconnues pour de la S-F.
"Gu?pes et th?rapie g?nique"

[alaric]

Pour ceux qui d?sire avoir des esp?ces disparu dans leurs mondes de SF, nous n'en avons jamais ?t? aussi proche comme nous l'indique cet article:

Premier clonage (presque) r?ussi d'un animal disparu


Enfin, pour ceux qui d?sire avoir un monde avec certaines cr?atures marines ?tranges vous avez le choix entre :

- Les poissons bavards
- Diff?rences familiale
- Les myst?res de l'oc?an australe

Si certains d?sires plus de docs sur d'?tranges animaux des fonds marins faites moi signe.

[Lùani]

Si certains d?sires plus de docs sur d'?tranges animaux des fonds marins faites moi signe.

Si tu as des infos sur les diathom?es, je prends...
- je sais d?j? : qu'elles ont un adn super-complexe, qui contient ? la fois des morceaux d'animal et de plante (et l? je prendrais bien des infos en plus si quelqu'un en a)
- qu'elles peuvent fabriquer du verre en puisant le silice dans l'eau de mer (un verre poreux plein de qualit?s)
- qu'elles ne sont pas si vieilles que ?a (apparues au Jurassique)
- qu'elles ont ?t? cr??s sur terre ? l'image d'une race d'Et qui voulait v?rifier que les conditions de vie sur terre ?taient compatibles avec leur survie... euh... non, l? je m'?gare...

[alaric]

ok, je vais voir ce que j'ai exactement sur le sujet.

Je les posts d?s que possible.

[tsahel]

Luani : tu peux toujours commencer par l? :
diatom?e

Tsahel

[alaric]

Apr?s avoir fouill? dans mes documents (c'est un peu fouillis je dois dire), je n'ai malheureusement que peu d'informations compl?mentaires ? ce que tu peux trouver sur le lien de wikip?dia donn? par Tsahel.

J'ai cependant un ou deux sites sur lesquels des d?tails pourraient te combler.

- taxonomie

- annuaire scientifique sur les diatom?es

D?sol? de ne pas pouvoir en faire plus.

[Lùani]

Merci alaric. Gr?ce aux photos, je sais maintenant ? quoi ressemblent mes ET....

(Bon, je stocke tout ?a dans ma bo?te ? id?es... Il faut encore que ?a m?risse un peu)

[alaric]

Aujourd'hui, voici un lien gr?ce ? la th?orie des cordes entre les trous noirs et le plasma (pas le sanguin).


Et pour ceux qui cherchent des informations des ann?es 1930, des exp?riences amusantes du grand public: lien